本学科积极融入“美丽中国”建设，除红树林保护修复外，还参与了厦门筼筜湖综合整治、九龙江流域治理、长汀水土流失治理、宁夏隆德县水源地保护、18 省生态扶贫等，其中筼筜湖综合整治获得 UNDP 高度评价，被作为东亚海域污染防治管理示范工程和海洋生态修复经典案例，向全球推广。2020 年“筼筜湖综合整治模式”等“厦门经验”被国家发改委列入国家生态文明试验区改革举措和经验做法推广清单。

本学科多人担任筼筜湖管理中心科学顾问，先后指导及参与筼筜湖综合整治方案编制、湖区立法管理、吹填造岛脱盐绿化、湖区红树林造林、引鸟工程建设、水体良性运行模式构建、水生态稳定调控等，使筼筜湖从鱼虾灭绝的臭湖变成了“高颜值生态之城”——厦门的“城市会客厅”。2017 年金砖会议期间，习近平主席与普京总统的会晤就特意安排在筼筜湖畔的筼筜书院举行。

“十三五”期间，本学科继续助力筼筜湖生态修复，使湖区水质从 IV 类提升到 III 类（海水水质标准），透明度提高 30%，赤潮发生天数减少 30%，生态服务价值提高了 22%。并将在筼筜湖治理中研发的海水生态浮床等技术和相关治理模式与经验推广到浙江梅山湾、广东品清湖、海南三亚湾、广西茅尾海和宁德三沙湾等多个海湾生态修复，取得良好成效。

在筼筜湖铺设自行研发的生态浮床开展生态修复